ERUA estructura su trabajo en varias líneas de acción, conocidas como Work Packages (WPs), que guían y organizan las actividades de la alianza para alcanzar sus objetivos. Cada WP se centra en áreas clave como la innovación educativa, la investigación interdisciplinaria, la participación estudiantil, la sostenibilidad y la gobernanza compartida.

Estas líneas de acción permiten coordinar proyectos y programas específicos, facilitando la colaboración entre las universidades socias y promoviendo la implicación de estudiantes, personal académico y técnico. Gracias a esta estructura, ERUA puede abordar de manera integral los desafíos sociales y educativos, impulsar la movilidad, generar conocimiento conjunto y fomentar la transformación de la educación superior en Europa.